在马耳他岛上发现的巨石神庙充满着神秘的色彩。古人建造的神庙是人类智慧的惊人壮举，在当时，人们简直难以相信。巨石神庙被认为是世界上最古老的独立式建筑，比埃及的金字塔和英国的巨石阵还要古老。它们是由公元前4000年至公元前2500年在马耳他文明的吉甘提亚（Ggantija，世界上最古老的宗教建筑）时期被称为“神庙建造者”的古代居民们所建造的。几个世纪以来，这些庙宇被历史所湮没，被岁月的土壤所覆盖，直到考古学家在19世纪重新发现它们的时候，发现它们被保存得依然非常完好。它们的重要性和独特性使得它们可以被联合国教科文组织列为世界文化遗产名录。

建设者

人们对于这些惊人建筑的建设者们知之甚少。目前所知的是，这些建造者是马耳他第一批居民的后代，大约在公元前5000年左右从西西里岛来到这里的。这些人是农民，以崇拜母神而闻名。（母神：威卡宗教中最强大的人物之一。她是女性之美、生育和养育能力的缩影。在异教徒的时期，母神统治着人类和动物的繁衍能力，主管着生命、繁衍和重生。）关于在寺庙里举行的神圣仪式，人们所知道的唯一事实是，那里有动物祭祀仪式，里面的房间只够容纳几个人，这意味着很可能只有精神领袖才会在这里举行仪式。然而，对于这些在公元前2500年左右神秘消失，又没有留下任何文字痕迹的古人，至今依然存在很多未解之谜。

建造神庙

神庙由众多石头建成，有许多三叶草形状的房间，还有不完整的圆屋顶，屋顶可能是用木杆和兽皮盖的。在寺庙里发现了一个婀娜多姿的女人雕像，代表着一个女神。随着神庙建设工期的推进，神庙变得越来越复杂，从三叶草形状变到更圆的平面。可以肯定的说，由于当时神庙的建造和维护非常的复杂，现在它们显然在人们的生活中发挥了非常重要的作用。

姆纳德拉石庙（Mnajdra Temples）

姆纳德拉石庙坐落在马耳他南海岸的悬崖上，离奎伦迪（Qrendi，位于马耳他南部的一个村庄）很近。姆纳德拉石庙包含三个独立的寺庙，共用一个椭圆形的前院。第一个石庙，上殿，建于公元前3600年至3200年之间。第三座石庙，即下殿，建于公元前3150年至公元前2500年之间，可以说是马耳他最令人印象深刻的巨石寺庙了。这座寺庙有一条从前院过来的的入口通道。前院有许多长椅。石庙排列布局得很好，所以太阳在春分时分可以直接照射进来。石庙装饰得非常奇妙，石头上的螺旋形雕刻和窗户让你可以看到寺庙里的其他房间。

哈扎伊姆神庙（Hagar Qim Temples）

哈扎伊姆神庙离姆纳德拉神庙只有几百米远，但这些石庙并不是用坚硬的石头建成的，建于公元前3600年至3200年左右，年代已较为久远。这里的石庙由一个主殿和三个周围的巨石结构组成，并且还有一个前院和姆纳德拉石庙非常像。

比尔泽布贾石庙（Borg In-Nadur Temples）

马耳他最年轻的寺庙之一是比尔泽布贾石庙。它始建于公元前2000年左右，可以在马耳他南部靠近比尔泽布贾（马耳他南部的一个城镇，人口约为8,000。这个名字在马耳他语里是指“橄榄树之岛”）的地方找到。这座石庙建筑很有意思，因为它有四个后殿和青铜器时代的部落，都有防御墙。同样值得注意的是，防御墙是在居民区前面建造的，保护居民区不受到可能来自陆地的攻击，但来自后面的大海的攻击除外。

马耳他其他重要的寺庙还有南部城镇塔西安附近的塔西安巨石庙（Tarxien Temples），西北部姆贾尔岛的塔哈格拉特石庙（Ta’ Hagrat），还有姆贾尔岛附近的斯科巴石庙（Skorba）。